Bei der Recherche zu einem Problem bin ich darauf gestossen, dass der WSUS Server auch gewartet werden muss, wenn man ihn mit SCCM verwaltet. Bei SCCM CB (Current Branch) gibt es eine neue Option, dass der WSUS Bereinigung-Assistent durch den SCCM Server verwaltet wird. Dies genügt aber nicht ganz als regelmässige Wartung.
In diesem Technet Beitrag und in diesem Beitrag von Kent Agerlund wird beschrieben, wie man vorgehen muss, um die WSUS Datenbank zu pflegen. Hoffentlich wird das in einer zukünftigen Version vollständig automatisiert.